開くとマクロでポップアップが出るファイルについて

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Excelを開くと自動でポップアップが二度出てくるマクロがあります
並列アクティビティを使用してエクセルアプリケーションスコープとクリックを同時に設置することで一つ目のポップアップは回避できますが、二つ目のポップアップをクリックしようとしても、Excelアプリケーションスコープが永遠にすすみません おそらくポップアップの表示が終わらない限り開ききると認識しないのだと思います。
ちなみにアプリケーションを開くと並列を組み合わせると二つ目のポップアップまで実行できます

そのためアプリケーションを開くで一度エクセルを開き、開いてるエクセルに対して文字を書き込んだらしたいのですがどうすれば良いですか？

アプリケーションを開くでWindow変数を取得はできますがそれをワークブック型変数に変換することは可能ですか…？