可能だと思います。
以前に他の方の質問で、ファイルやフォルダーを検索するアクティビティについて回答しました。こちらの内容で検索を行うと、条件に該当するファイルが複数ある場合にはその配列を得ることが出来ます。 これを活用して、特定のフォルダを親フォルダとするファイルだけを検索するようにクエリを設定して配列を得て、その配列を用いて繰り返し処理をすればよいかと思います。